55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1681 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  100 
 
 
1079 aa  2063    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  82.33 
 
 
1108 aa  1521    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  40.06 
 
 
966 aa  326  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  38.48 
 
 
911 aa  248  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  39.91 
 
 
993 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  38.15 
 
 
990 aa  223  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  37.68 
 
 
978 aa  219  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  53.85 
 
 
727 aa  102  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.5 
 
 
474 aa  100  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  45.45 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.19 
 
 
835 aa  85.1  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  46.59 
 
 
535 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  42.35 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  41.41 
 
 
480 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  38.83 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  40.19 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  39.08 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  39 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  37.04 
 
 
281 aa  69.7  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  36.25 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  39.76 
 
 
458 aa  65.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  48.68 
 
 
276 aa  64.7  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  37.97 
 
 
472 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  37.97 
 
 
472 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  42.68 
 
 
340 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  38.38 
 
 
529 aa  61.6  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35.29 
 
 
356 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
328 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 
340 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
307 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  39.02 
 
 
334 aa  60.1  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
328 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  37.97 
 
 
242 aa  59.3  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  37.97 
 
 
299 aa  58.9  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 
363 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  28.7 
 
 
277 aa  58.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
291 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 
340 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  31.96 
 
 
347 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 
341 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 
321 aa  56.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 
533 aa  55.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 
343 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
313 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  35.44 
 
 
458 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 
363 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 
330 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
380 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 
318 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
291 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  31.25 
 
 
359 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  31.17 
 
 
198 aa  48.5  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  23.32 
 
 
237 aa  48.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  35.8 
 
 
249 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  33.33 
 
 
467 aa  44.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>