42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3397 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  938    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  84.65 
 
 		 474 aa  766    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  98.73 
 
 		 472 aa  927    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  45.96 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  51.52 
 
 		 458 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  46.46 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  28.97 
 
 		 511 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  29.94 
 
 		 458 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  31.38 
 
 		 990 aa  113  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  31.38 
 
 		 978 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  30.09 
 
 		 966 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  31.55 
 
 		 993 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  31.75 
 
 		 535 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  28.54 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  28.64 
 
 		 911 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  29.77 
 
 		 1079 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  31.04 
 
 		 545 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  29.54 
 
 		 727 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  30.55 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  32.54 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  30 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  29.18 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  30.39 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  20.95 
 
 		 835 aa  63.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  35.44 
 
 		 1108 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30.66 
 
 		 277 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  37.8 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  27.41 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  34.21 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.62 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  31.63 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  33.67 
 
 		 378 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3058  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.1 
 
 		 578 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 328 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 573 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 328 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  29.76 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  33.77 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  33.68 
 
 		 194 aa  43.9  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>