60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3063 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 440 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  38.11 
 
 		 467 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  44.35 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  40.96 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  40.96 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  40.96 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  34.52 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 886 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  35.64 
 
 		 292 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  33.77 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  37.66 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 264 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 		 725 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  29.82 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 934 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  32.47 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  31.25 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  35.14 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  31.52 
 
 		 281 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 892 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 269 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.67 
 
 		 620 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  34.15 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  34.15 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.11 
 
 		 340 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  29.73 
 
 		 929 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  27.1 
 
 		 966 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  33.75 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 285 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  32.18 
 
 		 918 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  28.7 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  30.21 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 917 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 269 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  26.53 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 282 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  32.88 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 2240 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  27.57 
 
 		 615 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 282 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 923 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 324 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 1161 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 268 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>