234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1778 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 269 aa  530  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  88.81 
 
 		 281 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  77.57 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  74.21 
 
 		 269 aa  367  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  74.68 
 
 		 309 aa  348  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  66.79 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  68.36 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  59.18 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.8 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  55.31 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.8 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  50.75 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  47.13 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  48.46 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  50.53 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  49.74 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  48.06 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.12 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  47.69 
 
 		 326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  44.39 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.81 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.11 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.71 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 927 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.13 
 
 		 732 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 505 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.17 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  30.85 
 
 		 541 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 607 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  28.41 
 
 		 566 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 629 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 557 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 503 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 465 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 595 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  27.8 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1676 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 1073 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.81 
 
 		 810 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  33.58 
 
 		 2679 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.49 
 
 		 395 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  31.67 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  37.23 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  33.05 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 586 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 599 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 587 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 718 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 2651 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.87 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 177 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 402 aa  48.9  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 816 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 		 714 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 393 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 1290 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.39 
 
 		 623 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  51.06 
 
 		 799 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 878 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  33.73 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 767 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.84 
 
 		 619 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  34.26 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  24.32 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 1737 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 		 955 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 762 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  28.41 
 
 		 792 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.11 
 
 		 837 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 2262 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.03 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 567 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 633 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 543 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 		 385 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 955 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 472 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52971  anaphase-promoting complex component  25.35 
 
 		 698 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 566 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>