155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52971 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52971  anaphase-promoting complex component  100 
 
 
698 aa  1446    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  41.35 
 
 
840 aa  434  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08002  20S cyclosome subunit (Cut9/Cdc16), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02590)  39.23 
 
 
756 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  31.65 
 
 
612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  27.95 
 
 
381 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.08 
 
 
833 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.27 
 
 
576 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23.61 
 
 
929 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
927 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 
366 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 
782 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
465 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
582 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.93 
 
 
810 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
315 aa  54.7  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35663  predicted protein  24.46 
 
 
502 aa  54.3  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00548899  normal  0.928712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.48 
 
 
643 aa  54.3  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 
632 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
878 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
329 aa  53.9  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.42 
 
 
1013 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 
3145 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
402 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
247 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
643 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
511 aa  51.6  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
652 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
750 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.25 
 
 
1238 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  20.63 
 
 
397 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
562 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
567 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
248 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.59 
 
 
2240 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  25.27 
 
 
272 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.82 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 
557 aa  49.7  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
594 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
968 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.04 
 
 
936 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24 
 
 
745 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
934 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 
383 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
1252 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.68 
 
 
1979 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
563 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.53 
 
 
1009 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
804 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  21.18 
 
 
1077 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
543 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
577 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.83 
 
 
577 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
652 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.86 
 
 
957 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
292 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  22.92 
 
 
690 aa  48.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
991 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  24.77 
 
 
417 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 
743 aa  47.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.26 
 
 
837 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.35 
 
 
1676 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21931  hypothetical protein  29.55 
 
 
387 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.33 
 
 
742 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  27.07 
 
 
385 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
1252 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
323 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  26.01 
 
 
779 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.24 
 
 
733 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.8 
 
 
729 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.36 
 
 
603 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
690 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
269 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
955 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
399 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
592 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
1486 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
714 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 
553 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
288 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
359 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
1360 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08013  20S cyclosome subunit (APC8), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02440)  26.27 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380459  normal  0.107376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  26.73 
 
 
924 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.05 
 
 
577 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
685 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 
566 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
1371 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  21.88 
 
 
614 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 
394 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
635 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 
652 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
1060 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
635 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  20.61 
 
 
279 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
4079 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>