More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2937 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.39 
 
 		 250 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  59.83 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  61.11 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  55.33 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  51.64 
 
 		 254 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.84 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.33 
 
 		 538 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.9 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 566 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.49 
 
 		 733 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.77 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 758 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 612 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 636 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 1737 aa  78.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 3145 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.62 
 
 		 887 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 637 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 		 632 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 611 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 870 aa  75.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 614 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 614 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 614 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 626 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1676 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.38 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.38 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.96 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.58 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  31.12 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.05 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 620 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.35 
 
 		 577 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.24 
 
 		 577 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1094 aa  72  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 3035 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 878 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.43 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.9 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.36 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 879 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.19 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 689 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 1154 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1421 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.26 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.26 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2852  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 		 818 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.24 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 864 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.02 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 1034 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 448 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 2240 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  25.12 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.36 
 
 		 1694 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.18 
 
 		 875 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 4489 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 546 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  27.89 
 
 		 817 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 847 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>