More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0829 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 394 aa  770    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.72 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.42 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 878 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 2240 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.16 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 3145 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 1737 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.93 
 
 		 1067 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1421 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1276 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 		 1056 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 239 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 927 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 818 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  23.66 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.64 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1676 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.84 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.17 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.18 
 
 		 581 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 629 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 3301 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 2262 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 3172 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.6 
 
 		 733 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.62 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.34 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.25 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.67 
 
 		 1056 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  26.74 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 562 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.16 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.72 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.2 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.94 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.73 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1112 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.24 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 2262 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.51 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 1252 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.6 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 1252 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1450 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25.99 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 792 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.8 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 542 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 4079 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27 
 
 		 887 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 968 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 804 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>