176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03820 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  100 
 
 
840 aa  1739    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52971  anaphase-promoting complex component  41.35 
 
 
698 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08002  20S cyclosome subunit (Cut9/Cdc16), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02590)  33.1 
 
 
756 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  30.93 
 
 
612 aa  218  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  32.17 
 
 
381 aa  167  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 
818 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.08 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
878 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
409 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 
988 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
927 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.92 
 
 
810 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
1022 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
3145 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 
1056 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
409 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 
784 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
405 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 
1154 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.79 
 
 
632 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
392 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.87 
 
 
733 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.51 
 
 
397 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
245 aa  58.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  19.63 
 
 
750 aa  57.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
466 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  21.53 
 
 
820 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.55 
 
 
1056 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  26.99 
 
 
773 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
374 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.33 
 
 
355 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
589 aa  54.7  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.7 
 
 
833 aa  54.7  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
301 aa  54.7  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
399 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
361 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  20.08 
 
 
884 aa  54.3  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  24.39 
 
 
725 aa  53.9  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  26.17 
 
 
799 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
258 aa  53.9  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  28.66 
 
 
538 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  32.12 
 
 
929 aa  52.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  27.5 
 
 
385 aa  52  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 
290 aa  51.6  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  18.3 
 
 
629 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  22.62 
 
 
815 aa  51.2  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
180 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.86 
 
 
577 aa  51.2  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  20.81 
 
 
649 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.48 
 
 
750 aa  50.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.22 
 
 
577 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
315 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 
301 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
185 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  22.77 
 
 
272 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
342 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  28.16 
 
 
456 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 
219 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  25.88 
 
 
571 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.71 
 
 
742 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.95 
 
 
357 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1421 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  19.02 
 
 
1252 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  31.18 
 
 
185 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
178 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  22.27 
 
 
295 aa  50.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  22.27 
 
 
295 aa  49.3  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  22.77 
 
 
1101 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 
291 aa  49.3  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 
689 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
291 aa  49.3  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 
782 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  21.6 
 
 
708 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  24.7 
 
 
584 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.78 
 
 
269 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  18.53 
 
 
466 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
594 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.81 
 
 
725 aa  48.9  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  23.9 
 
 
836 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.02 
 
 
267 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 
279 aa  48.5  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
706 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2590  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
464 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  29.75 
 
 
2679 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.45 
 
 
557 aa  48.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.18 
 
 
306 aa  48.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
320 aa  48.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
198 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 
540 aa  48.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
324 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 
299 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 
263 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
471 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1450 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.35 
 
 
822 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
248 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
643 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>