More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0180 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 178 aa  351  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  68 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  58.82 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  51.7 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  58.82 
 
 		 174 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  52.35 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  56.96 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  37.43 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  32.32 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  36.81 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  37.79 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  41.45 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  39.87 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  40.13 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  39.61 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  29.93 
 
 		 1101 aa  65.1  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 593 aa  64.3  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 		 1252 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 		 1252 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 291 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 878 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 833 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.67 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 1022 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 3145 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 1056 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 1979 aa  57.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  41.79 
 
 		 890 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 320 aa  57.4  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.03 
 
 		 850 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 750 aa  55.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  30.43 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.1 
 
 		 1056 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 3560 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.83 
 
 		 863 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 562 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 818 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 352 aa  54.7  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.39 
 
 		 988 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.12 
 
 		 407 aa  54.3  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 265 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 456 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.8 
 
 		 832 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 643 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.59 
 
 		 884 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 1486 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  26.06 
 
 		 1213 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 265 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 1013 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.01 
 
 		 733 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 4079 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 232 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 274 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 784 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 2240 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 992 aa  50.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1450 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.19 
 
 		 758 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.56 
 
 		 715 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.39 
 
 		 620 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26453  predicted protein  39.66 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.484012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1406 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 589 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  25.62 
 
 		 840 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 689 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 280 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.78 
 
 		 1764 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 898 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 1737 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 792 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 594 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.86 
 
 		 575 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1238 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.83 
 
 		 397 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 297 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 297 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.67 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 750 aa  48.5  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  26.23 
 
 		 518 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 632 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1121 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.9 
 
 		 632 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>