95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18721 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  100 
 
 
185 aa  366  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  96.22 
 
 
185 aa  329  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  94.59 
 
 
185 aa  327  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  83.78 
 
 
185 aa  317  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  50.27 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  48.65 
 
 
185 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  47.8 
 
 
187 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  46.39 
 
 
171 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  47.1 
 
 
172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
178 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 
175 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
177 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.26 
 
 
177 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
180 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
175 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  29.45 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.94 
 
 
1022 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 
809 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
1276 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
392 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1406 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
687 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.17 
 
 
582 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 
626 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
566 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
448 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
269 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
352 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
605 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
293 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
988 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 
1056 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 
818 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.18 
 
 
1056 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
1049 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
592 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
563 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 
711 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1005 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  37.14 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
291 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  34.52 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
718 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
499 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.43 
 
 
784 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
635 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31 
 
 
1550 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 
1056 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
611 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
875 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
635 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
284 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.77 
 
 
546 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
1450 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
643 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
393 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
562 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
1737 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
617 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  32.38 
 
 
681 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
714 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
3560 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
512 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.85 
 
 
1764 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
639 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
270 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  28.74 
 
 
373 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
612 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
688 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
270 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
750 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
636 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.14 
 
 
539 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
2240 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.64 
 
 
267 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.42 
 
 
581 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
523 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  31.31 
 
 
792 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 
247 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
232 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 
566 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
4079 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
1034 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
4489 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  34.07 
 
 
936 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.31 
 
 
493 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>