More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0112 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
546 aa  1122    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  44.1 
 
 
1010 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.73 
 
 
204 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.23 
 
 
203 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.02 
 
 
204 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.27 
 
 
218 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  33.67 
 
 
200 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  36 
 
 
198 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  31.02 
 
 
204 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.65 
 
 
204 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.35 
 
 
204 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.35 
 
 
204 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.95 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
202 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
208 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.49 
 
 
207 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.47 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.79 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.49 
 
 
213 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.27 
 
 
206 aa  77  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
207 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.42 
 
 
205 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.85 
 
 
212 aa  76.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 
197 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.09 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.57 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.4 
 
 
205 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.49 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.72 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.28 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.14 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.2 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 
210 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.81 
 
 
198 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.59 
 
 
205 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 
204 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 
205 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
4079 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.66 
 
 
622 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
403 aa  63.9  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
409 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
4489 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
516 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.16 
 
 
620 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
3145 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.75 
 
 
764 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
1094 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 
352 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
718 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  28.87 
 
 
252 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  24.38 
 
 
992 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.63 
 
 
201 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
3560 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1534 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 
1694 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.21 
 
 
810 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
620 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.68 
 
 
661 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 
314 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.05 
 
 
201 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 
576 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
363 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
363 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
364 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.2 
 
 
739 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.03 
 
 
213 aa  57  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 
436 aa  57  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.54 
 
 
213 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
767 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
392 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 
626 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
566 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
706 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
1445 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.47 
 
 
202 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
3301 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.94 
 
 
370 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  30.08 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.37 
 
 
211 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
212 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.67 
 
 
213 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.99 
 
 
219 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
878 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
1252 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
1252 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.3 
 
 
589 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.58 
 
 
206 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1406 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
392 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.92 
 
 
211 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
221 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
1757 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.54 
 
 
212 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>