69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0056 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  335  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  80.12 
 
 		 171 aa  254  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  68.64 
 
 		 187 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  60.24 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  60.24 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  59.06 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  45.51 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  46.71 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  44.91 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  44.91 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  31.93 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 448 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 486 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 4489 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 686 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 992 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.46 
 
 		 550 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 436 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 593 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 589 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 592 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.45 
 
 		 1694 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.69 
 
 		 566 aa  44.3  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 898 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 293 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 744 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1450 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 3560 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.05 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 512 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  32.08 
 
 		 548 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 394 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3035 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  32 
 
 		 792 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 878 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 3145 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.95 
 
 		 764 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 		 689 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32 
 
 		 807 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  31.2 
 
 		 395 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 1737 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46 
 
 		 330 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 186 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.1 
 
 		 626 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.79 
 
 		 682 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 297 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1192 aa  40.8  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 1276 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 297 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 715 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.66 
 
 		 397 aa  40.8  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 352 aa  40.8  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 		 638 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>