286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1274 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  52.35 
 
 		 178 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  51.45 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.24 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  48.24 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  51.2 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  49.68 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  50.87 
 
 		 174 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  40.24 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  38.01 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  43.53 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  38.65 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  42.5 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  38.32 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  37.75 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  40.65 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  37.75 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.76 
 
 		 1022 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 3145 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 		 1056 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.65 
 
 		 988 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1450 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 		 1056 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  36.79 
 
 		 733 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 		 626 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  30.33 
 
 		 1213 aa  55.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 		 878 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.23 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 556 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 534 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.36 
 
 		 585 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 632 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.92 
 
 		 784 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 605 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  35.24 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 352 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  31.19 
 
 		 395 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 		 818 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.62 
 
 		 863 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 686 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 649 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 586 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.98 
 
 		 626 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.98 
 
 		 626 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 737 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.98 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.98 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 274 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 614 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 274 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.38 
 
 		 456 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1406 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 247 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.93 
 
 		 820 aa  50.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 632 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 3301 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 486 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 3172 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.17 
 
 		 561 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  37.84 
 
 		 832 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.52 
 
 		 681 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.17 
 
 		 561 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 890 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.33 
 
 		 1764 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 688 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 		 979 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  42.86 
 
 		 569 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 573 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1737 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 1040 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.67 
 
 		 1694 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 593 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 		 248 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 200 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.3 
 
 		 622 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 847 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 522 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 565 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>