120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00551 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  58.29 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  70 
 
 		 172 aa  217  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  56.68 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  56.15 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  60.95 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  47.8 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  45.16 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  46.15 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  45.05 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  40.65 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 174 aa  99  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.13 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  30.43 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1450 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1005 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.25 
 
 		 254 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1276 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 352 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 587 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.39 
 
 		 747 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 1252 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 1252 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 566 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.31 
 
 		 764 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 771 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 878 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 688 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 645 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  30.17 
 
 		 395 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.96 
 
 		 1022 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.7 
 
 		 622 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.98 
 
 		 689 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.91 
 
 		 550 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1138 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  33.94 
 
 		 548 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 3145 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 512 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 626 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 792 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 614 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  35.92 
 
 		 733 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 614 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 614 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 762 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 744 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 1034 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 614 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.95 
 
 		 441 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 392 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 441 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 626 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.46 
 
 		 810 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  44.7  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 2240 aa  44.7  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 614 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 643 aa  44.7  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 592 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.79 
 
 		 875 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 436 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2299  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 448 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 589 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 898 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 890 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 605 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.4 
 
 		 807 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  38.89 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 594 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 		 1213 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.81 
 
 		 850 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.65 
 
 		 637 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.68 
 
 		 1764 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 573 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.65 
 
 		 638 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 737 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 486 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.08 
 
 		 1694 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  27.97 
 
 		 615 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.23 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.9 
 
 		 2413 aa  42.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  36.22 
 
 		 475 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.28 
 
 		 582 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 708 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  34.48 
 
 		 499 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 718 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.82 
 
 		 647 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>