291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2669 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  63.19 
 
 
191 aa  244  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.35 
 
 
185 aa  211  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  51.96 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  48 
 
 
248 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  46.1 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.71 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  41.26 
 
 
306 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  39.57 
 
 
582 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.24 
 
 
334 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  38.19 
 
 
462 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  35.15 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  38 
 
 
581 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40 
 
 
706 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.84 
 
 
706 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
178 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 
308 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
404 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  37.98 
 
 
539 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  32.92 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.86 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.86 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
280 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  34.65 
 
 
442 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 
542 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
547 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.5 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
649 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.85 
 
 
1022 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 
750 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
605 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
988 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.43 
 
 
820 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
428 aa  72  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.43 
 
 
1240 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.11 
 
 
818 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.85 
 
 
1056 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
446 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
1827 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.11 
 
 
784 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 
471 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.79 
 
 
738 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
1421 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.39 
 
 
1056 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
286 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
286 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
280 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.59 
 
 
746 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
352 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
318 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
425 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
306 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0909  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
303 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0457691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
150 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
305 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
271 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
284 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
295 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
1192 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 
233 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 
635 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
804 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
593 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
458 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
292 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
388 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>