More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3320 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  60.34 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  58.29 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  51.7 
 
 
178 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  57.05 
 
 
175 aa  187  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.33 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  52.33 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  51.2 
 
 
175 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  34.88 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  33.92 
 
 
185 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  35.48 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  36.42 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  37.18 
 
 
172 aa  88.2  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  35.1 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  32.94 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
185 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 
185 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  32.75 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.2 
 
 
1056 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
297 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
297 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
1056 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.92 
 
 
1022 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.31 
 
 
988 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  29.2 
 
 
1101 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
392 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
3145 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
3172 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 
293 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.6 
 
 
818 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
3301 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  27.74 
 
 
456 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
352 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
594 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
878 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.14 
 
 
863 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 
1979 aa  55.1  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.61 
 
 
810 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
605 aa  54.7  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.8 
 
 
784 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
301 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.46 
 
 
850 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  33.85 
 
 
538 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 
286 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
286 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.51 
 
 
820 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
258 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
290 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.81 
 
 
619 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
649 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 
1154 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
286 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
265 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 
629 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
833 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1737 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
1421 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.69 
 
 
1013 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.6 
 
 
764 aa  50.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
890 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  25.41 
 
 
840 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  45 
 
 
534 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
292 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
265 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
387 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  29.36 
 
 
395 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
718 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
1406 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 
677 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.18 
 
 
832 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 
288 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  23.91 
 
 
575 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
247 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
573 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
265 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 
2240 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
320 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
1450 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
916 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
632 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
629 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 
758 aa  48.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  30.88 
 
 
566 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
292 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
393 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
543 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 
457 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
291 aa  47.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
3035 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
375 aa  47.8  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.71 
 
 
340 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
593 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
295 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>