90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1755 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  94.59 
 
 		 185 aa  331  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  94.59 
 
 		 185 aa  328  3e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  84.86 
 
 		 185 aa  322  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  48.11 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  48.24 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  45.95 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  45.05 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  45.78 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  45.16 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.42 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  27.61 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.44 
 
 		 1022 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.24 
 
 		 582 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 392 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 293 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 1276 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 818 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.24 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.7 
 
 		 988 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1406 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 750 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 		 1056 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1049 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1827 aa  44.7  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 875 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 784 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 563 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.26 
 
 		 809 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.73 
 
 		 539 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  37.14 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 605 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.77 
 
 		 546 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 		 626 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 4489 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 699 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 566 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 688 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 750 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 562 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 		 839 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 1450 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32173  predicted protein  28.18 
 
 		 575 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 643 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 718 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 595 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31 
 
 		 1550 aa  42.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 687 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 617 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 689 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 499 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1737 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 635 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 592 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 611 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 162 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1038 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 635 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.4 
 
 		 706 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  37.23 
 
 		 936 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  33.85 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3172 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 441 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 441 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 512 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 878 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>