159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17891 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  100 
 
 
185 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  60.54 
 
 
185 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  59.46 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  58.29 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  61.99 
 
 
171 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  60.25 
 
 
172 aa  191  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  50.81 
 
 
185 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  50.27 
 
 
185 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  49.19 
 
 
185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  48.11 
 
 
185 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.82 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
174 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
174 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
180 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  40.65 
 
 
175 aa  98.2  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  31.52 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 
810 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 
878 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
1252 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
1252 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 
1213 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
3035 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
289 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
3560 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
592 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 
448 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
1276 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
1450 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  40.26 
 
 
875 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
352 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
565 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  30 
 
 
682 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
605 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
3145 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1406 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
715 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  41.56 
 
 
688 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
441 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 
441 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 
1022 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.84 
 
 
473 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
283 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
245 aa  47.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
828 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
601 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
1737 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
643 aa  47.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.05 
 
 
620 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
594 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
563 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  27.64 
 
 
615 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
4079 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 
632 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 
293 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
833 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
593 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
287 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
291 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 
2240 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
732 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
620 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  41.46 
 
 
745 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.22 
 
 
758 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
927 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.41 
 
 
648 aa  45.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
689 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.79 
 
 
397 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
394 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
871 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
1486 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.53 
 
 
287 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
828 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
505 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.71 
 
 
887 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
828 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.27 
 
 
742 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
827 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
587 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
279 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
699 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06840  phosphoprotein phosphatase, putative  24.62 
 
 
586 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.66618  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32173  predicted protein  33.77 
 
 
575 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623051  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
293 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
1106 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  35.35 
 
 
542 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
767 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
297 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
423 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.38 
 
 
740 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  30.88 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>