More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32173 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32173  predicted protein  100 
 
 
575 aa  1192    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623051  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31719  peroxisomal targeting signal 1 receptor  38.62 
 
 
712 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0456101  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77798  predicted protein  31.55 
 
 
605 aa  134  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10215  peroxisomal targeting signal (PTS1) receptor protein peroxin 5 (Eurofung)  32.76 
 
 
655 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000612411  normal  0.654696 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  36.84 
 
 
799 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02670  peroxisome targeting signal receptor, putative  31.32 
 
 
696 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.996882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1276 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 
1694 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
878 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
927 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.81 
 
 
1007 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 
576 aa  77.4  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.64 
 
 
810 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.33 
 
 
623 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.64 
 
 
730 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
4079 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
1276 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 
758 aa  70.5  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.49 
 
 
764 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.8 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1192 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.28 
 
 
707 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.74 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
711 aa  67.4  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.85 
 
 
1138 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.19 
 
 
622 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
3145 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.23 
 
 
725 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 
836 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
465 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
344 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
1486 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.5 
 
 
979 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.61 
 
 
1979 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
361 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
761 aa  63.9  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.81 
 
 
743 aa  63.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
366 aa  63.9  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 
465 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
409 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
634 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.37 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
784 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
4489 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
3301 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 
297 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
1737 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.18 
 
 
1013 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.78 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
523 aa  61.6  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
467 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.2 
 
 
820 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.21 
 
 
865 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 
566 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.38 
 
 
586 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
466 aa  61.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
716 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
409 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
409 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 
542 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.75 
 
 
564 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
362 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.62 
 
 
439 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  23.36 
 
 
334 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.81 
 
 
314 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
620 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
3560 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
544 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
244 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  34.46 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
750 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.68 
 
 
875 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
649 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
699 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
452 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
465 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 
1049 aa  58.9  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
1827 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
217 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
1069 aa  58.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.75 
 
 
1067 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
833 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
279 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
3035 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>