More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3268 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
441 aa  910    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
441 aa  910    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  56.64 
 
 
1252 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  53.69 
 
 
1252 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  40.28 
 
 
718 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 
878 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  38.85 
 
 
875 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
681 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.9 
 
 
810 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
685 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  36.42 
 
 
764 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.41 
 
 
632 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.82 
 
 
725 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.15 
 
 
622 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
828 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  38.97 
 
 
594 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
732 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 
789 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
833 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
3145 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 
637 aa  93.2  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
824 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
828 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
637 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 
1737 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
833 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
639 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
635 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
635 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
611 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
626 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  34.51 
 
 
661 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
614 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
626 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
626 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
614 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
614 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
614 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
750 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
828 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
612 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
636 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
602 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
612 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
615 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.33 
 
 
865 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
754 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
909 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
543 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.88 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
754 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
3035 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  36.55 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
739 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
3560 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  34.04 
 
 
816 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.8 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
808 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
605 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
573 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  36.62 
 
 
780 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
1450 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  38.46 
 
 
864 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
4489 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  29.19 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
542 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  30.92 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.93 
 
 
1694 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
3301 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
619 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
595 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  33.59 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
968 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
1406 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
732 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
1827 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.07 
 
 
1764 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
502 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
708 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
714 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 
293 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  31.21 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
827 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  34.04 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
667 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.92 
 
 
603 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>