94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3509 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 231 aa  453  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  33.15 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.15 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  35.22 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.4 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  32.6 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  30.06 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  26.49 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  30.72 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 619 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.64 
 
 		 619 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 955 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 633 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 631 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 622 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  31.9 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 639 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 617 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.36 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 633 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 824 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 326 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1129 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 572 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 		 626 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 585 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 620 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 1213 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 636 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 266 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 612 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 566 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.61 
 
 		 620 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 605 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 573 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 1600 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 522 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1858  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.73 
 
 		 884 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1005 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 607 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  31.82 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 637 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.91 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 593 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 1737 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1450 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 621 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 934 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 629 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.63 
 
 		 583 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 282 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  28.26 
 
 		 530 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 595 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 354 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 1034 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 611 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 617 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.42 
 
 		 677 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>