More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3177 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 
878 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.4 
 
 
810 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.6 
 
 
725 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  34.17 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.97 
 
 
875 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
594 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
3560 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
979 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  33 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
716 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.08 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3035 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.24 
 
 
622 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
4489 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
1737 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
362 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
448 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
3301 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
3172 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
927 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.57 
 
 
764 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
649 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 
681 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  32.8 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
685 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  39 
 
 
643 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
1252 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
1252 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
762 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
505 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
3145 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.11 
 
 
1694 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.22 
 
 
820 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
909 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
374 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.2 
 
 
603 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
847 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
827 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
297 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
542 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.47 
 
 
1154 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
297 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
4079 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1486 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
556 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 
818 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  31.03 
 
 
434 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
739 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  37.3 
 
 
865 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
750 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.35 
 
 
367 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
780 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
1094 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
784 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
573 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  35.11 
 
 
661 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
637 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 
836 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
486 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
639 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
591 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 
1034 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  28.76 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.79 
 
 
585 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 
293 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
718 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1005 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
714 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 
707 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
750 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  32.65 
 
 
832 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
534 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
636 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 
988 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.04 
 
 
733 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
824 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
1421 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>