More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0781 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 924 aa  1844    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.43 
 
 		 929 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 952 aa  197  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 934 aa  191  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.98 
 
 		 937 aa  165  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 931 aa  164  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 923 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.22 
 
 		 935 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  21.69 
 
 		 924 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 		 940 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 927 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.4 
 
 		 882 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 860 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 873 aa  96.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.36 
 
 		 882 aa  92  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.6 
 
 		 924 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 		 729 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1676 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 		 557 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  20.06 
 
 		 955 aa  81.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  20.72 
 
 		 884 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.26 
 
 		 2240 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.79 
 
 		 729 aa  77  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 		 931 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  21.36 
 
 		 864 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  19.4 
 
 		 883 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  22.66 
 
 		 933 aa  70.5  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.56 
 
 		 992 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.29 
 
 		 786 aa  68.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 2262 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.57 
 
 		 884 aa  67.8  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 2262 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 645 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 722 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.39 
 
 		 764 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.77 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 4079 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.35 
 
 		 1737 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1178 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.74 
 
 		 887 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.31 
 
 		 565 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 		 833 aa  62  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.91 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.45 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 402 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 927 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  25.93 
 
 		 379 aa  60.5  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  19.61 
 
 		 767 aa  60.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 647 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 3590 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 571 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  20.68 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 568 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  22.74 
 
 		 936 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  19.43 
 
 		 944 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.09 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  22.42 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.38 
 
 		 1067 aa  58.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.33 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  24.9 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 3145 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.32 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 878 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  29.46 
 
 		 584 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.01 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.77 
 
 		 367 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 520 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 886 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.18 
 
 		 364 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 359 aa  57.4  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 505 aa  57.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.23 
 
 		 1056 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 486 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  19.95 
 
 		 448 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 673 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.63 
 
 		 622 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 576 aa  56.6  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.29 
 
 		 878 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 1252 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>