230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2882 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 767 aa  1540    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2082  hypothetical protein  37.01 
 
 		 932 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.602266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 716 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 810 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 878 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  31.09 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3145 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 237 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.55 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.95 
 
 		 1979 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  33.05 
 
 		 340 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.52 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1297 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 864 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 637 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 363 aa  55.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 203 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 452 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 762 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 836 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 620 aa  54.7  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 739 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 466 aa  54.7  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  30.95 
 
 		 299 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  23.3 
 
 		 1240 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 629 aa  54.3  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 374 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 602 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.16 
 
 		 708 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 314 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 244 aa  53.9  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 639 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.68 
 
 		 730 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 581 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  37.97 
 
 		 262 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 750 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 718 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.79 
 
 		 332 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  26.43 
 
 		 508 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 927 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1276 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 280 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  27.78 
 
 		 407 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 213 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 3035 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 465 aa  52.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 326 aa  52  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 635 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 711 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 3560 aa  51.6  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 635 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.34 
 
 		 1101 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 611 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 583 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 689 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 595 aa  50.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 4079 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 465 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 2240 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 909 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.52 
 
 		 603 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  26.4 
 
 		 872 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 4489 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2765  tetratricopeptide TPR_2  28.15 
 
 		 291 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1085 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 		 415 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 282 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 636 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 330 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 743 aa  48.9  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 202 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 697 aa  49.3  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 716 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 435 aa  49.3  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1105 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  23.42 
 
 		 174 aa  48.9  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.44 
 
 		 417 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 311 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 542 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 254 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 589 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 1290 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 		 465 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 290 aa  48.5  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 599 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 257 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 217 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>