More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0295 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  82.42 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  66.79 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.87 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  67.56 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  69.06 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  66.12 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  61.18 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.27 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.49 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  49.75 
 
 		 271 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  43.56 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  45.99 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  45.92 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  44.14 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  45.29 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  47.16 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 268 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  46.11 
 
 		 326 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.11 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.67 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 639 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.17 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 637 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.92 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  39.05 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  39.05 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 611 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 636 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 612 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  38.1 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  39.81 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.9 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 592 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.63 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 		 955 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.91 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 878 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 743 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.03 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.18 
 
 		 732 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 465 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.87 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 4489 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 573 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 543 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 4079 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 626 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  31.05 
 
 		 541 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 572 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.81 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 824 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.02 
 
 		 1007 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 767 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  26.25 
 
 		 619 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 612 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 750 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 626 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.32 
 
 		 816 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 523 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 594 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 566 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 425 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 522 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 909 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 542 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>