More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2423 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 415 aa  842    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 3035 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 878 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 810 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.65 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28 
 
 		 795 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 681 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.43 
 
 		 816 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 718 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 1737 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.75 
 
 		 626 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 614 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  41.46 
 
 		 626 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  41.46 
 
 		 614 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  41.46 
 
 		 614 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 614 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 685 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 1276 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.09 
 
 		 561 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.09 
 
 		 561 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 620 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 632 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 637 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 615 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 612 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.31 
 
 		 865 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.66 
 
 		 887 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 927 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 635 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 635 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 2240 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.36 
 
 		 732 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 909 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 639 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 636 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 612 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 611 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 637 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1094 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.6 
 
 		 620 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 689 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 617 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.73 
 
 		 875 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.43 
 
 		 725 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 362 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.19 
 
 		 1694 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 3560 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 4489 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 767 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 4079 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.93 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.35 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 955 aa  84  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 750 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 3172 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 602 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 740 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.73 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.46 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 3145 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.71 
 
 		 707 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.06 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.04 
 
 		 714 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 750 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.68 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1827 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 935 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.67 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.11 
 
 		 733 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 715 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.65 
 
 		 730 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 747 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1406 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 833 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 732 aa  76.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 764 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.26 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1676 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.63 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 3301 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 		 1022 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>