251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1879 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
324 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  92.19 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  89.58 
 
 
336 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  97.96 
 
 
309 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  97.96 
 
 
309 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  96.67 
 
 
307 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  56.5 
 
 
292 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  57.72 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  56.73 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  30.48 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  29.33 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
1445 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  27.69 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.75 
 
 
1838 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  33.91 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 
810 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.93 
 
 
887 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
1737 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
878 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.66 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.62 
 
 
622 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  33.63 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
562 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 
979 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.77 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.18 
 
 
764 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
727 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  32.74 
 
 
278 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
968 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
269 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  25.12 
 
 
262 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.23 
 
 
725 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
1534 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
909 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.11 
 
 
594 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.48 
 
 
816 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
934 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
1406 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.6 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.47 
 
 
837 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.57 
 
 
1154 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
215 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 
626 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  29.83 
 
 
440 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.57 
 
 
266 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 
626 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 
614 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
614 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
1757 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
681 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
1094 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 
737 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
614 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
614 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 
614 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
750 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
4079 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 
689 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.94 
 
 
1676 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 
502 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.85 
 
 
676 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
502 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
789 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
739 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.98 
 
 
732 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.28 
 
 
626 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 
955 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
265 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
522 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
3560 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
725 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
647 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
1197 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
189 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
448 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
632 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
643 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
566 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 
512 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.33 
 
 
545 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
542 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>