More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7038 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  73.75 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  72.2 
 
 		 269 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  69.7 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.95 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  65.56 
 
 		 290 aa  340  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  69.35 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  61.7 
 
 		 279 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.79 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  50.4 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.04 
 
 		 282 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  54.42 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  51.74 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  51.82 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  51.94 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  51.01 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  50.45 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  49.75 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.28 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  41.02 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  40.72 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.47 
 
 		 587 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.19 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.49 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 927 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  35.58 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  35.58 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  36.27 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 612 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.75 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.05 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  34.26 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.71 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  26.29 
 
 		 619 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  29.79 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.26 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  26.24 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.53 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.32 
 
 		 810 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.89 
 
 		 887 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.7 
 
 		 621 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 878 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.55 
 
 		 622 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.7 
 
 		 621 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 597 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 589 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 566 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.55 
 
 		 764 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 		 677 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 621 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.23 
 
 		 576 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 		 818 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 523 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 522 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 629 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 573 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 543 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 		 436 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 610 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2060  tetratricopeptide TPR_2  31.39 
 
 		 984 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 767 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 4079 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 		 784 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 610 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.36 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 2262 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 743 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.28 
 
 		 623 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  32.26 
 
 		 510 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 626 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  25.56 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 955 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 614 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 614 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 171 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>