188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3203 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 282 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  99.29 
 
 		 282 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  88.3 
 
 		 282 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  60.25 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  65.92 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  51.44 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  64.45 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  48.59 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.21 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  47.37 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  51.1 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  50.88 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  44.06 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  42.98 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  44.21 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  46.35 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  43.01 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 617 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 621 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  37.27 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.66 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  28.33 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.83 
 
 		 795 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  37.25 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  26.06 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  37.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  37.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 595 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 870 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 594 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 543 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.88 
 
 		 573 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 592 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 415 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 629 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 767 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 566 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 585 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.54 
 
 		 425 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 592 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 565 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 864 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 		 572 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 563 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 610 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  37.06 
 
 		 397 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1714 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 579 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 927 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.23 
 
 		 566 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.99 
 
 		 623 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  37.25 
 
 		 502 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 502 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 542 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1138 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 612 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 		 955 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 		 648 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 2651 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.63 
 
 		 992 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 638 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 		 614 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 		 576 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.61 
 
 		 714 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.84 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.52 
 
 		 584 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.07 
 
 		 587 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.07 
 
 		 545 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 716 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 362 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 		 626 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 		 626 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 614 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 614 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>