259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3427 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  97.89 
 
 		 285 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  84.93 
 
 		 292 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  58.55 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  58.16 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  58.05 
 
 		 333 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  58.01 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  57.63 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  57.63 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  29.72 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 1737 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  23.81 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 968 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 643 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  36.27 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 		 979 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 594 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.23 
 
 		 622 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.76 
 
 		 764 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.75 
 
 		 725 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 685 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 878 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1197 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 639 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.97 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 1252 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.43 
 
 		 577 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 1252 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 909 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  30.91 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.71 
 
 		 577 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 952 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 681 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.19 
 
 		 733 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 172 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 505 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 811 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 810 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 423 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 626 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 636 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.3 
 
 		 887 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 637 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 547 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  45.59 
 
 		 573 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 614 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.32 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1757 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  27.17 
 
 		 585 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 575 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 635 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 3172 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 635 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 900 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 637 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 612 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 689 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 402 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1676 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 533 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>