167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6795 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  86.87 
 
 		 266 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.9 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.74 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  64.35 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  59.49 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  56.54 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  62.77 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.74 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  60.11 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  50.61 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  50.69 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  47.2 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  50.22 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  46.59 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  47.28 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  43.88 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  42.74 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  45.37 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  43.27 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  41.24 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  40.21 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  41.24 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  41.24 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.88 
 
 		 795 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 542 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.94 
 
 		 882 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 		 955 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  25.57 
 
 		 619 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 589 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.39 
 
 		 882 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  48.78 
 
 		 467 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 415 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 2651 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 884 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 351 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 866 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.45 
 
 		 587 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.45 
 
 		 545 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 629 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.32 
 
 		 572 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.69 
 
 		 780 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 595 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  24.5 
 
 		 621 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  34.09 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  24.5 
 
 		 621 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 621 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 667 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.58 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  30.15 
 
 		 792 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 393 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  35.09 
 
 		 2679 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.31 
 
 		 762 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 		 643 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1676 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.31 
 
 		 762 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1714 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 573 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  39.82 
 
 		 503 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  34.07 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.93 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  35.87 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 593 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 592 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 573 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  33.94 
 
 		 575 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  30.21 
 
 		 584 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 566 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 556 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 610 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 586 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.92 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 620 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 563 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 4489 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  27.62 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>