More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4902 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
737 aa  1512    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  37.72 
 
 
764 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.46 
 
 
725 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 
622 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
637 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
681 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.33 
 
 
1676 aa  84.7  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  35.42 
 
 
594 aa  84.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
878 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
3035 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
754 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.04 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.68 
 
 
810 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
909 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.94 
 
 
875 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1252 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1252 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
754 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.83 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
718 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
1154 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
3145 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
828 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.62 
 
 
603 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
824 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
4489 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.85 
 
 
865 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
1737 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  31.76 
 
 
832 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
1827 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  33.09 
 
 
887 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 
632 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
833 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
3560 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  38.14 
 
 
661 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  32.05 
 
 
837 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3172 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
448 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
486 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
1486 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
968 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
3301 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.34 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
711 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.82 
 
 
1056 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.07 
 
 
816 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.73 
 
 
314 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
542 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
789 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
637 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
289 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
1094 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
573 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
708 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  31.18 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.39 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  32.39 
 
 
676 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 
624 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  30.57 
 
 
682 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
2240 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 
988 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  35.11 
 
 
979 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
750 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1085 aa  68.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.22 
 
 
936 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
187 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.47 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
955 aa  67.8  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.58 
 
 
437 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
1694 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
818 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
465 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
636 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.07 
 
 
733 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
732 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.21 
 
 
266 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
466 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.69 
 
 
561 aa  66.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30 
 
 
626 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
265 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
617 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 
442 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>