More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5686 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  60.57 
 
 		 269 aa  291  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.51 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  61.18 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  63.64 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  64 
 
 		 281 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  61.4 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  62.67 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.52 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.94 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  52.73 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  47.98 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  55.43 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  48.51 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  48.48 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  42.42 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  48.64 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  50.26 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 268 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.8 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  43.85 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.82 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 927 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.56 
 
 		 795 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.8 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  34.26 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.47 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 767 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.19 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.16 
 
 		 883 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.54 
 
 		 1007 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 557 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.33 
 
 		 887 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  32.69 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  32.69 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.94 
 
 		 836 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.83 
 
 		 545 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.21 
 
 		 632 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  35.25 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  30.61 
 
 		 575 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.49 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  32.86 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  34.26 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.95 
 
 		 584 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.86 
 
 		 648 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 		 566 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1676 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  27.71 
 
 		 444 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 567 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 568 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 226 aa  52.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 595 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.04 
 
 		 587 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 542 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 662 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.84 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 523 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  35.77 
 
 		 551 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.34 
 
 		 573 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 667 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 743 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 594 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 599 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  22.02 
 
 		 573 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  26.32 
 
 		 619 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  28.77 
 
 		 541 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 573 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.31 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 629 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 502 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.69 
 
 		 603 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 		 955 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 543 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.17 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 565 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>