241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3719 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 267 aa  533  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  70.19 
 
 		 269 aa  361  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  69.06 
 
 		 290 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  68.36 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.05 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  69.14 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  69.35 
 
 		 309 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  62.45 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.83 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.37 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  47.97 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  49.78 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  48.64 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  45.37 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  47.6 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  43.23 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  47.11 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  48 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.24 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  43.72 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  35.97 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  35.45 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.89 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.84 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  36.79 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  36.79 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.11 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 810 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.21 
 
 		 732 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  37.5 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 955 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1069 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  25.45 
 
 		 619 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 		 955 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  35.35 
 
 		 584 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 716 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 743 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 385 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.82 
 
 		 436 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 557 aa  53.1  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 448 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 562 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 542 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 402 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 595 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 878 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 465 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 		 566 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 4489 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.95 
 
 		 587 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.75 
 
 		 887 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 632 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.52 
 
 		 545 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 574 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 884 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.4 
 
 		 882 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.5 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 836 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  30.37 
 
 		 541 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.76 
 
 		 992 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 610 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 543 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 597 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 725 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 750 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28 
 
 		 395 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.76 
 
 		 882 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 573 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 366 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 435 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.43 
 
 		 762 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1127 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  31.43 
 
 		 762 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.95 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 		 818 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.19 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 564 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>