65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0114 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  29.44 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  29.44 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  30.05 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.69 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.88 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  34.26 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.8 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.25 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 884 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 548 aa  46.2  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 556 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  32.26 
 
 		 395 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  35.92 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 		 440 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 579 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  33.02 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 744 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  33.02 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.86 
 
 		 979 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1096 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 860 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 632 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 934 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 883 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  35.78 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 878 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  35.78 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 484 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  26.88 
 
 		 120 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1220  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 399 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0163733  hitchhiker  0.0019262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 758 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 573 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  34.57 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 767 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 268 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 468 aa  42  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>