126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2664 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  70.33 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0357  TPR repeat-containing protein  65.95 
 
 		 273 aa  254  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0759  TPR repeat-containing protein  59.89 
 
 		 187 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  58.56 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.56 
 
 		 2401 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  31.11 
 
 		 690 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 537 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 804 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.04 
 
 		 695 aa  54.3  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.14 
 
 		 837 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 456 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 550 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 448 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 3301 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 3172 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 503 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 587 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 364 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 		 358 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1096 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 767 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.39 
 
 		 875 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 643 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.55 
 
 		 561 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.05 
 
 		 340 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 505 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 968 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 866 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 697 aa  48.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 306 aa  48.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 670 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  26.04 
 
 		 389 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 467 aa  47.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 452 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 739 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 		 924 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.82 
 
 		 561 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 715 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.23 
 
 		 887 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 878 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 599 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.33 
 
 		 733 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 827 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  27.66 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  26.04 
 
 		 634 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 624 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 581 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 3035 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 917 aa  45.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.69 
 
 		 810 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 602 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1133 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 808 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 583 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  36.04 
 
 		 673 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 927 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.74 
 
 		 299 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 		 626 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 718 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 604 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 594 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 750 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 686 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.18 
 
 		 725 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 632 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1116 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 409 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 824 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  30.72 
 
 		 767 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 585 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  31.58 
 
 		 335 aa  43.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1456  hypothetical protein  32 
 
 		 805 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 944 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  24.58 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 942 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.79 
 
 		 594 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.97 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 795 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 641 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 750 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 923 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 573 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 2262 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 634 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  22.86 
 
 		 977 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1676 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 652 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 967 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.32 
 
 		 545 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 636 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  39.53 
 
 		 601 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>