158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3867 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1093 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.67 
 
 		 1093 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1116 aa  2322    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  40.04 
 
 		 1124 aa  791    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  36.53 
 
 		 1106 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 1126 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.84 
 
 		 1100 aa  1283    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 		 1124 aa  790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 1124 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  42.63 
 
 		 1096 aa  873    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1093 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  39.67 
 
 		 1093 aa  792    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 1093 aa  788    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 1146 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  41.59 
 
 		 1151 aa  515  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1072 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  22.25 
 
 		 1046 aa  192  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  25.95 
 
 		 717 aa  98.2  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 878 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  24.82 
 
 		 709 aa  88.6  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.96 
 
 		 810 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 668 aa  80.1  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  25.27 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  27.66 
 
 		 710 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.43 
 
 		 745 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 4079 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 927 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 883 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 466 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.4 
 
 		 695 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 1979 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0357  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 2240 aa  58.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.72 
 
 		 397 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 		 465 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 286 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 329 aa  57.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 409 aa  57.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 286 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 		 582 aa  57.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 543 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.08 
 
 		 586 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 465 aa  56.2  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 758 aa  56.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.31 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 471 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2590  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 464 aa  55.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 833 aa  55.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.79 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 3035 aa  55.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 409 aa  54.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.56 
 
 		 340 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 425 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 		 465 aa  53.5  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.04 
 
 		 818 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 593 aa  53.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 		 632 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  19.62 
 
 		 725 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 808 aa  53.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 374 aa  52.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.04 
 
 		 784 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 273 aa  52.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 290 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  26.09 
 
 		 797 aa  52.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 602 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.05 
 
 		 782 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.27 
 
 		 252 aa  52  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.74 
 
 		 587 aa  52  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 572 aa  52  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 3145 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1676 aa  51.6  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 		 1737 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.55 
 
 		 882 aa  51.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 430 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 287 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 486 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  20.1 
 
 		 409 aa  51.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 		 1406 aa  51.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 288 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 357 aa  51.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 572 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 		 550 aa  50.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  20.95 
 
 		 957 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 596 aa  50.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.71 
 
 		 667 aa  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 		 3301 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  25.15 
 
 		 330 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.77 
 
 		 988 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.44 
 
 		 1056 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 591 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 212 aa  49.3  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  22.85 
 
 		 750 aa  48.9  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.4 
 
 		 391 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 417 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 301 aa  48.9  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>