85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3594 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.14 
 
 		 1093 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  36.97 
 
 		 1126 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 1124 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1100 aa  2306    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 1124 aa  793    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 1096 aa  887    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  56.84 
 
 		 1116 aa  1268    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  41.04 
 
 		 1093 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  41.04 
 
 		 1093 aa  796    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  41.15 
 
 		 1093 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 1093 aa  792    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  40.44 
 
 		 1146 aa  811    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  40.88 
 
 		 1124 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  36.64 
 
 		 1106 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1151 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1072 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  24.54 
 
 		 1046 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  28.01 
 
 		 709 aa  98.2  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  27.4 
 
 		 710 aa  91.3  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  24.22 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  23.77 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 668 aa  73.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 2240 aa  64.3  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.52 
 
 		 1056 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.95 
 
 		 3301 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 1737 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1276 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.49 
 
 		 725 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  23.44 
 
 		 648 aa  55.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 3172 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 486 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.43 
 
 		 1979 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 824 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.21 
 
 		 818 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 827 aa  52.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 572 aa  52  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  19.63 
 
 		 808 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 1486 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.59 
 
 		 573 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  19.9 
 
 		 1371 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  27.11 
 
 		 333 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 3145 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.14 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 357 aa  49.3  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  23.64 
 
 		 667 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.25 
 
 		 733 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 689 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.79 
 
 		 602 aa  48.9  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.77 
 
 		 676 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 792 aa  48.5  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.7 
 
 		 784 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 357 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 649 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.05 
 
 		 340 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 288 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 566 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 767 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 364 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 4489 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.83 
 
 		 1056 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.1 
 
 		 391 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 762 aa  47.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 329 aa  47  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.61 
 
 		 758 aa  47.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1676 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 3035 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 		 750 aa  46.2  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.78 
 
 		 548 aa  46.2  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 409 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 601 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 864 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 3560 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.88 
 
 		 572 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 605 aa  45.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 602 aa  45.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0894  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30 
 
 		 253 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000416211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 1694 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 409 aa  44.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.09 
 
 		 681 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 510 aa  44.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  23.26 
 
 		 587 aa  44.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>