23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1342 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 668 aa  1304    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  42.95 
 
 		 642 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  42.72 
 
 		 667 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1096 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1093 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1093 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1093 aa  87  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1124 aa  87  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1124 aa  87  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1093 aa  87  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  27.45 
 
 		 1124 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 1093 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1116 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1151 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1072 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  27.81 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 1100 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.18 
 
 		 1046 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  26.18 
 
 		 1126 aa  72  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  25.39 
 
 		 1106 aa  70.5  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  25.86 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  28.97 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>