85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3370 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 1096 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  44.91 
 
 		 1126 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.44 
 
 		 1100 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 1116 aa  841    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1146 aa  2336    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  43.92 
 
 		 1106 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.89 
 
 		 1093 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1093 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1093 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  49.11 
 
 		 1151 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1093 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 1093 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 1124 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1124 aa  622  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  35.84 
 
 		 1124 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1072 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  22.7 
 
 		 1046 aa  165  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  26.97 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  24.68 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  26.11 
 
 		 710 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.82 
 
 		 810 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 878 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  24.61 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  30.67 
 
 		 333 aa  62  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  48.48 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 409 aa  56.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  46.15 
 
 		 614 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  46.15 
 
 		 626 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  46.15 
 
 		 626 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  46.15 
 
 		 614 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 614 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 614 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 614 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 620 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 637 aa  54.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 635 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 611 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.97 
 
 		 620 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 635 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 890 aa  52.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.04 
 
 		 626 aa  52.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 612 aa  52  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 636 aa  51.6  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 543 aa  51.6  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.74 
 
 		 1056 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.42 
 
 		 730 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 615 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.48 
 
 		 988 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 1276 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 681 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 220 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 409 aa  48.9  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.22 
 
 		 667 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 847 aa  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 2240 aa  47.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.61 
 
 		 887 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.87 
 
 		 739 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  27.66 
 
 		 815 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 605 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 624 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 927 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 392 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 362 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 802 aa  45.8  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 185 aa  46.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 314 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.47 
 
 		 391 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 502 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 689 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.74 
 
 		 795 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 3145 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 366 aa  45.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.97 
 
 		 1694 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3901  heat shock protein DnaJ domain protein  32.67 
 
 		 341 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 280 aa  45.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 2651 aa  45.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 374 aa  45.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 427 aa  45.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 828 aa  44.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 638 aa  44.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 3172 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>