44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4231 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.74 
 
 		 1093 aa  1332    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.19 
 
 		 1100 aa  888    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 1116 aa  873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  59.63 
 
 		 1093 aa  1328    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  59.63 
 
 		 1124 aa  1323    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 1146 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  59.47 
 
 		 1093 aa  1325    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  59.63 
 
 		 1093 aa  1329    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1096 aa  2256    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  59.63 
 
 		 1124 aa  1328    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  59.45 
 
 		 1124 aa  1324    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  59.63 
 
 		 1093 aa  1328    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  36.52 
 
 		 1106 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  40.88 
 
 		 1126 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1072 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.87 
 
 		 1046 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 1151 aa  104  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  28.06 
 
 		 709 aa  102  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  24.67 
 
 		 642 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  26.3 
 
 		 710 aa  88.2  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  25.89 
 
 		 717 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 668 aa  87.4  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.15 
 
 		 667 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  27.18 
 
 		 333 aa  60.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  31.45 
 
 		 330 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.98 
 
 		 810 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.11 
 
 		 927 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 484 aa  50.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 2240 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 878 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 		 508 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 314 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 543 aa  48.5  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.8 
 
 		 745 aa  48.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.7 
 
 		 1694 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 3301 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 750 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.74 
 
 		 407 aa  46.2  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 3145 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 534 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 446 aa  45.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 605 aa  45.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 1049 aa  45.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>