30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2702 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  98.44 
 
 		 1093 aa  2240    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.85 
 
 		 1100 aa  794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  40.04 
 
 		 1116 aa  782    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  98.9 
 
 		 1093 aa  2249    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  98.9 
 
 		 1093 aa  2249    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  97.99 
 
 		 1124 aa  2204    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1093 aa  2272    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  98.72 
 
 		 1093 aa  2246    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  59.47 
 
 		 1096 aa  1319    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  98.63 
 
 		 1124 aa  2247    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  98.54 
 
 		 1124 aa  2243    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 1146 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  35.28 
 
 		 1106 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  34 
 
 		 1126 aa  522  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  37.03 
 
 		 1151 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1072 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  21.78 
 
 		 1046 aa  148  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  29.41 
 
 		 717 aa  97.8  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  26.18 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  27.43 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 668 aa  82.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  24.04 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  22.87 
 
 		 667 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  27.04 
 
 		 330 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.09 
 
 		 725 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  25.24 
 
 		 333 aa  51.6  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  25.48 
 
 		 328 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 750 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  23.93 
 
 		 356 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  21.63 
 
 		 1004 aa  44.7  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>