35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2519 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  669    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  45.2 
 
 
328 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  42.73 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  37.98 
 
 
299 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  31.18 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  27.74 
 
 
311 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0611  hypothetical protein  27.46 
 
 
312 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.260773  normal  0.0246617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  29.67 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  26.81 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  27.21 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
1146 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
1096 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0427  hypothetical protein  29.57 
 
 
122 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  27.96 
 
 
1106 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  25.42 
 
 
709 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  23.89 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  25.24 
 
 
1124 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  25.24 
 
 
1093 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
1093 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  25.24 
 
 
1093 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
1093 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
1124 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
1124 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0641  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.226637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 
1093 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 
1100 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0944  hypothetical protein  35.51 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  25.82 
 
 
642 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  24.36 
 
 
710 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
1116 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  26.01 
 
 
1126 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  23.28 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  23.84 
 
 
717 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2023  hypothetical protein  24.45 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  25.7 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>