38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0341 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  34.23 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  32.75 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  32.33 
 
 
367 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  29.49 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  27.83 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0550  hypothetical protein  26.79 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.148328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  28.63 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  26.67 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  22.44 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0611  hypothetical protein  22.7 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.260773  normal  0.0246617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  30.94 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  28.09 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4195  hypothetical protein  26.35 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  28.74 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  28.74 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  26.18 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  24.86 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.16 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  25.73 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
311 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  29.01 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  25.42 
 
 
289 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  26.55 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  28.75 
 
 
284 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4327  hypothetical protein  25.27 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0641  hypothetical protein  39.47 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  28.69 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  29 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  28.65 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  23.17 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  21.94 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>