76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4246 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  89.62 
 
 		 289 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  88.58 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  79.93 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  57.79 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  55.71 
 
 		 293 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  57.09 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  48.24 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  39.01 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 353 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  37.33 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  37.19 
 
 		 357 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  36.97 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  36.97 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  36.97 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  36.97 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  36.27 
 
 		 357 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  34.03 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  34.03 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.68 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 353 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  36.43 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  33.68 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  32.1 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  35.14 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  34.46 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  35.68 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 382 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  34.03 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  30.87 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  30.14 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  30.19 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  30.19 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  29.82 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  28.79 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  30.59 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.2 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  28.73 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  27.8 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.46 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.55 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  31.82 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  26.12 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.45 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  27.06 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  24.67 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.52 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  23.3 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  23.81 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.62 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  23.51 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  23.47 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  23.47 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  25.66 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.21 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  27.34 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>