85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1183 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  80.62 
 
 		 289 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  79.93 
 
 		 289 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  79.93 
 
 		 289 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  57.34 
 
 		 293 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  56.9 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  54.98 
 
 		 291 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  48.59 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  38.13 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  37.5 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  36.45 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  35.42 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  36.84 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  36.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  36.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  36.14 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  36.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  36.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  36.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.58 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  32.08 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  30.66 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  34.22 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  34 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  34 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  34 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  34 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  34 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  33.6 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  31.93 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  32.8 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  33.2 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.72 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  28.67 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  31.44 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  31.84 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.82 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  30.86 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  25.98 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  24.6 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  28.22 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  27.75 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  28.82 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.97 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  21.77 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.38 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.38 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.38 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.93 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  25.32 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  24.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  24.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  23.76 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  25.15 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.61 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  24.68 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  22.82 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.79 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>