224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4435 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  49.83 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  46.18 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  46.9 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  44.63 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  44.71 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  44.11 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  41.28 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  43.49 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  41.1 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  42.56 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  41.58 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  41.91 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  37.09 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  40.67 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  36.67 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  36 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  40.82 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  35 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  35.33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  40.47 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  34.74 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  34.74 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  34.74 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  35.41 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  34.23 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  34.23 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  34.23 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  39.66 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  36.24 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  36.79 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  33.89 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  33.56 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  33.11 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  33.76 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  34.45 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  33.56 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  32.4 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  30.1 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.63 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.63 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.33 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  29.72 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.87 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25.94 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  31.29 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  26.16 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  30.22 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.92 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  33.64 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  33.64 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.71 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  30.49 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.71 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  26.72 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  31.1 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  30.06 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  31.48 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0348  Aldose 1-epimerase  20.33 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0152282  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  25.95 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  29.94 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  30.3 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  25.74 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>