108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3474 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  89.46 
 
 		 296 aa  544  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  38.85 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  37.37 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  37.37 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  37.37 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  37.37 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  37.37 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  37.02 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  37.37 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  36.46 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  39.56 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  40.44 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 357 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  38.89 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  36.48 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  38.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  38.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  38.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  38.89 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  38.89 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  35.98 
 
 		 352 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  38.08 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  37.3 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  33.2 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  33.2 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  38.98 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  33.61 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  34.03 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  32.3 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  32.93 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  32.8 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  29.12 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  28.63 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  32.38 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  27.05 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  29.83 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  27.16 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  28.46 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  27.8 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.8 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  28.41 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.46 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  25.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  21.32 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  27.18 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  23.85 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  26.59 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  24.68 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  24.68 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  26.26 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.51 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  24.1 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  25.34 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  28.46 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  23.9 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  20.95 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.35 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.78 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  22.9 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.49 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.49 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.37 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  23.49 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  29.55 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  25.45 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  22.62 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  23.75 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  23.35 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  23.75 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  23.75 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  21.6 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  21.6 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  21.6 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  23.75 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  22.37 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.71 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>