271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2997 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  67.79 
 
 
303 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  65.77 
 
 
303 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  48.97 
 
 
305 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  48.04 
 
 
307 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  45.18 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  45.07 
 
 
306 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  42 
 
 
307 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 
294 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  40.74 
 
 
318 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  39.33 
 
 
327 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  40.83 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  42.19 
 
 
301 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  39.38 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  39.31 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  39.79 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  40.47 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  38.31 
 
 
299 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 
308 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  41.86 
 
 
299 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
308 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  38.28 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  38.28 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  38.28 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  38.06 
 
 
295 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  38.06 
 
 
295 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  38.06 
 
 
295 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  39.46 
 
 
321 aa  188  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  36.54 
 
 
299 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  40.8 
 
 
297 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  40.82 
 
 
303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  39.93 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  37.63 
 
 
311 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 
293 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  37.71 
 
 
319 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  35.88 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  35.12 
 
 
323 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  37.8 
 
 
290 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  35.69 
 
 
323 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  35.2 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  34.34 
 
 
300 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.9 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.99 
 
 
312 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.62 
 
 
345 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.51 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  30.94 
 
 
327 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  31.62 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.24 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  27.53 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.74 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.57 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.87 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  29.22 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  31.22 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  29.68 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  30.38 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  32.89 
 
 
362 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  26.89 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  24.89 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  28.98 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  26.59 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  27.72 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  28.34 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  30.48 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  30.88 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.93 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  28.1 
 
 
380 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  30.6 
 
 
387 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  27.55 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
387 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  28.02 
 
 
340 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  32.16 
 
 
397 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  27.54 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  30.14 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  24.83 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  26.67 
 
 
384 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.5 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  28.95 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  29.85 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  28 
 
 
344 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.31 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 
362 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  28.89 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  27.12 
 
 
402 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.92 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  24.38 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  27.81 
 
 
392 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>