149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4408 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  98.57 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  57.53 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  57.53 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  57.53 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  55.82 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  56.01 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  55.82 
 
 		 300 aa  332  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  55.14 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  55.14 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  55.14 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  40.83 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  38.31 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  34.71 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.56 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  35.96 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  34.92 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.89 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  32.19 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  31.23 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  32.63 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  34.98 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  31.96 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.62 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  32.99 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  32.99 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  30.21 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  29.29 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.83 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  28.47 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  28.91 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  29.11 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  28.38 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.36 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.02 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  27.4 
 
 		 323 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.93 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.25 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.78 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.06 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.74 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.66 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.56 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.51 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.41 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  23.63 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  31.19 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  23.27 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.81 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  30.19 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.65 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.21 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  27.17 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  26.56 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  30.19 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.28 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  23.25 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  24.91 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  26.04 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  26.86 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  23.16 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  27.5 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  21.58 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  25.52 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  25.42 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  27.08 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  23.67 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>